Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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VAMP3Q15836 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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VAMP3Q15836 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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VAMP3Q15836 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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VAMP3Q15836 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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VAMP3Q15836 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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VAMP3Q15836 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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VAMP3Q15836 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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