Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RBBP4Q09028 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms