Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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