Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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ECM1Q16610 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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ECM1Q16610 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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ECM1Q16610 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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ECM1Q16610 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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ECM1Q16610 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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ECM1Q16610 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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ECM1Q16610 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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ECM1Q16610 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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ECM1Q16610 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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ECM1Q16610 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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ECM1Q16610 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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