Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AL356309.1-201ENST00000425153 339 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC134879.1-201ENST00000426062 394 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 pRNA.12-201ENST00000614353 90 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 pRNA.3-201ENST00000615048 90 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 NUP98-202ENST00000355260 5628 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 FKBP15-201ENST00000238256 4336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 OR7E25P-202ENST00000641088 5937 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 UTY-209ENST00000537580 6490 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 GNG13-201ENST00000248150 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 GOT2P2-201ENST00000450663 1251 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC111194.1-201ENST00000509711 422 ntTSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 KLF7-202ENST00000412414 7954 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 NPIPB4-203ENST00000415645 3606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 MUC3A-203ENST00000483366 9944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 ZNF677-206ENST00000598513 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 KIF15-201ENST00000326047 4842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC139491.2-201ENST00000515403 3632 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 KCNA2-214ENST00000640774 6673 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 NFAT5-208ENST00000566899 4914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 GNG3-201ENST00000294117 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
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