Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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