Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ARL2-SNX15V9GYD0 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ARL2-SNX15V9GYD0 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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