Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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