Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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