Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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NME3Q13232 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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NME3Q13232 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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NME3Q13232 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
NME3Q13232 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
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NME3Q13232 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
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NME3Q13232 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
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NME3Q13232 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
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NME3Q13232 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NME3Q13232 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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