Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
DUSP4Q13115 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms