Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPREP23469 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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