Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms