Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms