Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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PDCD1Q15116 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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PDCD1Q15116 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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PDCD1Q15116 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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PDCD1Q15116 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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PDCD1Q15116 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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PDCD1Q15116 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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PDCD1Q15116 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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PDCD1Q15116 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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PDCD1Q15116 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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PDCD1Q15116 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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