Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RFTN1Q14699 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms