Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
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CHD3Q12873 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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CHD3Q12873 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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CHD3Q12873 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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CHD3Q12873 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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CHD3Q12873 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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CHD3Q12873 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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CHD3Q12873 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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