Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRGP23470 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms