Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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