Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms