Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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GPS1Q13098 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GPS1Q13098 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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GPS1Q13098 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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GPS1Q13098 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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GPS1Q13098 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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GPS1Q13098 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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