Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r25W4VSP2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms