Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm17190V9GX38 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm17190V9GX38 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm17190V9GX38 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm17190V9GX38 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm17190V9GX38 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm17190V9GX38 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm17190V9GX38 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm17190V9GX38 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm17190V9GX38 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm17190V9GX38 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm17190V9GX38 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm17190V9GX38 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm17190V9GX38 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17190V9GX38 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gm17190V9GX38 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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