Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc166S4R181 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc166S4R181 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms