Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z306

Slc22a4, Solute carrier family 22 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a4Q9Z306 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a4Q9Z306 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc22a4Q9Z306 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms