Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Knop1Q9Z2Q2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms