Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka4Q9Z2B9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka4Q9Z2B9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms