Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms