Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Opn3Q9WUK7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Opn3Q9WUK7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms