Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms