Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M5

Tpk1, Thiamin pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpk1Q9R0M5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpk1Q9R0M5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms