Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms