Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gpc6Q9R087 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc6Q9R087 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc6Q9R087 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc6Q9R087 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc6Q9R087 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc6Q9R087 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc6Q9R087 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc6Q9R087 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc6Q9R087 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc6Q9R087 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gpc6Q9R087 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc6Q9R087 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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