Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnnt3Q9QZ47 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnnt3Q9QZ47 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnnt3Q9QZ47 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnnt3Q9QZ47 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnnt3Q9QZ47 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnnt3Q9QZ47 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnnt3Q9QZ47 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnnt3Q9QZ47 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms