Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms