Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf354bQ9QXT9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms