Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms