Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lsm4Q9QXA5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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