Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid2Q9QUS6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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