Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

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Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Prg4Q9JM99 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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