Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms