Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms