Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot9Q9JKY0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms