Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole3Q9JKP7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms