Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Stx6Q9JKK1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx6Q9JKK1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms