Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard6bQ9JK83 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms