Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Tuba8Q9JJZ2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tuba8Q9JJZ2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tuba8Q9JJZ2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tuba8Q9JJZ2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tuba8Q9JJZ2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tuba8Q9JJZ2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Tuba8Q9JJZ2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tuba8Q9JJZ2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tuba8Q9JJZ2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Tuba8Q9JJZ2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tuba8Q9JJZ2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tuba8Q9JJZ2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Tuba8Q9JJZ2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tuba8Q9JJZ2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Tuba8Q9JJZ2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Tuba8Q9JJZ2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Tuba8Q9JJZ2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tuba8Q9JJZ2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tuba8Q9JJZ2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Tuba8Q9JJZ2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Tuba8Q9JJZ2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tuba8Q9JJZ2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tuba8Q9JJZ2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tuba8Q9JJZ2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tuba8Q9JJZ2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tuba8Q9JJZ2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tuba8Q9JJZ2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tuba8Q9JJZ2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tuba8Q9JJZ2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tuba8Q9JJZ2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms