Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms