Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Bco1Q9JJS6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Bco1Q9JJS6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Bco1Q9JJS6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Bco1Q9JJS6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Bco1Q9JJS6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Bco1Q9JJS6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Bco1Q9JJS6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Bco1Q9JJS6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Bco1Q9JJS6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Bco1Q9JJS6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Bco1Q9JJS6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Bco1Q9JJS6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bco1Q9JJS6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Bco1Q9JJS6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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