Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ercc6l2Q9JIM3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ercc6l2Q9JIM3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms